更新 'tasks/Haplotyper.wdl'

tasks/Haplotyper.wdl

@@ -29,7 +29,7 @@ task Haplotyper {
     fi
 
     sentieon driver -t $nt \
-    --interval ${regions} -r ${ref_dir}/${fasta} \
+    $INTERVAL -r ${ref_dir}/${fasta} \
     -i ${recaled_bam} \
     --algo Haplotyper -d ${dbsnp_dir}/${dbsnp} \
     ${sample}.Haplotyper.vcf