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tasks/TNseq.wdl
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| @@ -53,7 +53,7 @@ task sentieon_TNseq{ | |||
| --contamination ${sample_id}.contamination \ | |||
| --tumor_segments ${sample_id}.contamination.segments \ | |||
| --orientation_priors ${sample_id}.orientation \ | |||
| ${sample_id}.bwa_TNseq.vcf | |||
| ${sample_id}.TNseq.vcf | |||
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