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更新 'tasks/TNseq.wdl'

master
meng il y a 2 ans
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révision
a0d99defd0
1 fichiers modifiés avec 2 ajouts et 2 suppressions
  1. +2
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      tasks/TNseq.wdl

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tasks/TNseq.wdl Voir le fichier

@@ -31,14 +31,14 @@ task sentieon_TNseq{

if [[ -z "$REGION" ]]; then
INTERVAL="--interval ${regions} --interval_padding ${interval_padding}"
else:
else
INTERVAL=""
fi

if [[ -z "$NORMAL" ]];then
INPUT="-i ${tumor_bam} -i ${normal_bam}"
SAMPLE="--tumor_sample ${tumor_name} --normal_sample ${normal_name}"
else:
else
INPUT="-i ${tumor_bam}"
SAMPLE="--tumor_sample ${tumor_name}"
fi

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