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更新 'workflow.wdl'

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call AnnotSV.AnnotSV as manta_AnnotSV{ call AnnotSV.AnnotSV as manta_AnnotSV{
input: input:
sample=sample_id, sample=sample_id,
somatic_vcf= manta_calling_SV.manta_indel_vcf,
somatic_vcf= manta_calling_SV.somatic_vcf,
germline_vcf = manta_calling_SV.germline_vcf,
annotsv_database=annotsv_database, annotsv_database=annotsv_database,
docker=docker_annotsv, docker=docker_annotsv,
cluster_config=cluster_config, cluster_config=cluster_config,

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