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import "./tasks/fastqscreen.wdl" as fastqscreen

workflow {{ project_name }} {
String sample_id
File in1
File in2
File screen_ref_dir
File fastq_screen_conf

String docker
String cluster_config
String disk_size


call fastqscreen.fastq_screen as fastq_screen{
input:
read1=in1,
read2=in2,
sample=sample_id,
docker=docker,
cluster_config=cluster_config,
disk_size=disk_size

}
}

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