meng
/
Delly_pipeline
Sledovat 1
Oblíbit 0
Rozštěpit 0
Zdrojový kód Úkoly 0 Požadavky na natažení 0 Vydání 0 Wiki Aktivita
Delly pipeline for somatic SV
Nelze vybrat více než 25 témat Téma musí začínat písmenem nebo číslem, může obsahovat pomlčky („-“) a může být dlouhé až 35 znaků.
20 Revize
1 Větev
Větev: master
Větve Značky
${ item.name }
Vytvořit větev ${ searchTerm }
z „master“
${ noResults }
Delly_pipeline/defaults

11 lines
649B
Surový Trvalý odkaz Blame Historie 

  1.  {

  2.         "ref_fasta":"GRCh38.d1.vd1.fa",

  3.         "ref_fasta_dir":"oss://hcc1395/reference_genome/GRCh38.d1.vd1/",

  4.         "cluster_config":"OnDemand bcs.es.c.8xlarge img-ubuntu-vpc",

  5.         "disk_size":"600",

  6.         "docker_delly":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/delly:1.1.6",

  7. 		"annotsv_database":"oss://hcc1395/reference_genome/AnnotSV/",

  8.         "docker_annotsv":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/annotsv:3.1.3",

  9.         "baseline":"oss://hcc1395/reference_genome/MSIsensor/hg38_reference.list_baseline",

  10.         "docker_MSIsensor":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/msisensor-pro:1.2.0"

  11.     }