1 gewijzigde bestanden met toevoegingen van 1 en 1 verwijderingen
+ 1
- 1
tasks/CNVkit.wdl
Bestand weergeven
| @@ -20,7 +20,7 @@ task cnvkit{ | |||
| cnvkit.py batch ${tumor_bam} \ | |||
| -n ${normal_bam} \ | |||
| -m wgs \ | |||
| -f ${fasta} \ | |||
| -f ${ref_dir}/${fasta} \ | |||
| --annotate ${ref_flat} | |||
| cnvkit.py scatter ${sample}.cnr \ | |||
Laden…