Zhihui
il y a 4 ans
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tasks/fastp.wdl
Voir le fichier
| @@ -1,6 +1,6 @@ | |||
| task fastp { | |||
| File read | |||
| String sample_id=sub(basename(read1), "\\.(fastq|fq)\\.gz$", "") | |||
| String sample_id=sub(basename(read), "\\.(fastq|fq)\\.gz$", "") | |||
| String adapter_sequence | |||
| String adapter_sequence_r2 | |||
| String docker | |||
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