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更新 'tasks/samtools.wdl'

master
lizhihui il y a 6 ans
Parent
révision
a1f40d09bc
1 fichiers modifiés avec 1 ajouts et 1 suppressions
  1. +1
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      tasks/samtools.wdl

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tasks/samtools.wdl Voir le fichier

@@ -11,7 +11,7 @@ task samtools {
set -o pipefail
set -e
/opt/conda/bin/samtools view -bS ${sam} > ${bam}
/opt/conda/bin/samtools sort -m 5000000000 ${bam} -o ${sorted_bam}
/opt/conda/bin/samtools sort -m 500000000 ${bam} -o ${sorted_bam}
/opt/conda/bin/samtools index ${sorted_bam}
>>>


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