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tasks/batch.wdl
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| --output-reference ${sample_id}.reference.cnn \ | --output-reference ${sample_id}.reference.cnn \ | ||||
| --output-dir ./results/ \ | --output-dir ./results/ \ | ||||
| --drop-low-coverage \ | --drop-low-coverage \ | ||||
| --drop-outliers \ | |||||
| --diagram --scatter | --diagram --scatter | ||||
| cp ${sample_id}.reference.cnn ~/${sample_id}.reference.cnn | cp ${sample_id}.reference.cnn ~/${sample_id}.reference.cnn |
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