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revised ballgown

tags/v0.1.0
stead99 vor 5 Jahren
Ursprung
Commit
9b061197fd
1 geänderte Dateien mit 3 neuen und 3 gelöschten Zeilen
  1. +3
    -3
      tasks/ballgown.wdl

+ 3
- 3
tasks/ballgown.wdl Datei anzeigen

@@ -6,9 +6,9 @@ task ballgown {
String cluster

command <<<
#mkdir /cromwell_root/tmp/
#cp -r ${ballgown} /cromwell_root/tmp/
Rscript /usr/bin/ballgown.R ${ballgown} ${base}.txt
mkdir /cromwell_root/tmp/
cp -r ${sep=" " ballgown} /cromwell_root/tmp/ballgown
Rscript /usr/bin/ballgown.R /cromwell_root/tmp/ballgown/${base} ${base}.txt
>>>
runtime {

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