jingchengyang
/
rna-seq-tophat
Следить 1
В избранное 0
Форкнуть 0
Код Задачи 0 Pull Request'ы 0 Релизы 0 Вики Активность
RNA-seq pipeline with tophat2 + cufflinks + trimmomatic + fastqc
Вы не можете выбрать более 25 тем Темы должны начинаться с буквы или цифры, могут содержать дефисы(-) и должны содержать не более 35 символов.
2 коммитов
1 ветка
Дерево: 6d0e0de96e
Ветки Теги
${ item.name }
Создать ветку ${ searchTerm }
из '6d0e0de96e'
${ noResults }
rna-seq-tophat/defaults

8 lines
486B
Исходник Blame История 

  1. {

  2.   "{{ project_name }}.gtf": "oss://pgx-reference-data/reference/annotation/Homo_sapiens.GRCh38.93.gtf",

  3.   "fastqc_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/fastqc:v0.11.5",

  4.   "trimmomatic_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/trimmomatic:v0.3.8",

  5.   "tophat2_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/tophat2:2.0.14",

  6.   "cuffdiff2_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/cufflinks:v2.2.1"

  7. 

  8. }