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rna-seq-tophat
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RNA-seq pipeline with tophat2 + cufflinks + trimmomatic + fastqc
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Struktur: 5dca2f0a3d
Branches Tags
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Erstelle Branch ${ searchTerm }
von „5dca2f0a3d“
${ noResults }
rna-seq-tophat/defaults

6 Zeilen
381B
Originalformat Blame Verlauf 

  1. {

  2.   "fastqc_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/fastqc:v0.11.5",

  3.   "trimmomatic_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/trimmomatic:v0.3.8",

  4.   "tophat2_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/tophat2:2.0.14",

  5.   "cuffdiff2_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/cufflinks:v2.2.1"

  6. }