huangyechao 6 роки тому
джерело
коміт
2e24b8df7b
1 змінених файлів з 5 додано та 5 видалено
  1. +5
    -5
      README.md

+ 5
- 5
README.md Переглянути файл

@@ -68,7 +68,7 @@ choppy install huangyechao/wgs-germline
--fastq_1 测序数据的R1端
--fastq_2 测序数据的R2端
-K 10000000 该设置可用于比对过程中使得结果与线程数独立
-o 比对结果输出的文件名
-o 比对结果输出的文件名
```

**Dedup**
@@ -96,16 +96,16 @@ IS_METRIC_PDF the location and filename of the insertion size metrics report ou
**BQSR**

```bash
RECAL_DATA.TABLE the location and filename of the recalibration table
RECAL_DATA.TABLE.POST the location and filename of the temporary post recalibration table
RECAL_RESULT.CSV the location and filename of the temporary recalibration results output file used for plotting
RECAL_DATA.TABLE the location and filename of the recalibration table
RECAL_DATA.TABLE.POST the location and filename of the temporary post recalibration table
RECAL_RESULT.CSV the location and filename of the temporary recalibration results output file used for plotting
BQSR_PDF the location and filename of the BSQR results output file
```

**Haplotyper**

```bash
VARIANT_VCF the location and filename of the variant calling output file
VARIANT_VCF the location and filename of the variant calling output file
```

### APP输入

Завантаження…
Відмінити
Зберегти