1 mainītis faili ar 5 papildinājumiem un 6 dzēšanām
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README.md
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| ### 快速使用 | ### 快速使用 | ||||
| 1. 准备样本描述文件：samples.csv | |||||
| 需要包括3列： | |||||
| ##### 准备样本描述文件：samples.csv | |||||
| 需要包括3列： | |||||
| - sample_id：每个样本唯一的ID | - sample_id：每个样本唯一的ID | ||||
| - fastq：原始fastq地址 | - fastq：原始fastq地址 | ||||
| - down_to：downsample后目标read数 | - down_to：downsample后目标read数 | ||||
| 样表如下： | |||||
| 样表如下： | |||||
| | sample_id | fastq | down_to | | | sample_id | fastq | down_to | | ||||
| | -------- | -------- | -------- | | | -------- | -------- | -------- | | ||||
| 2. 批量提交任务 | |||||
| ##### 批量提交任务 | |||||
| ```bash | ```bash | ||||
| choppy batch chenziyin/downsample-latest <SAMPLES_CSV> --project-name <PROJECT_NAME> | choppy batch chenziyin/downsample-latest <SAMPLES_CSV> --project-name <PROJECT_NAME> |
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