@@ -28,17 +28,16 @@ choppy install chenziyin/downsample | |||
### 快速使用 | |||
1. 准备样本描述文件:samples.csv | |||
需要包括3列: | |||
##### 准备样本描述文件:samples.csv | |||
需要包括3列: | |||
- sample_id:每个样本唯一的ID | |||
- fastq:原始fastq地址 | |||
- down_to:downsample后目标read数 | |||
样表如下: | |||
样表如下: | |||
| sample_id | fastq | down_to | | |||
| -------- | -------- | -------- | | |||
@@ -48,7 +47,7 @@ choppy install chenziyin/downsample | |||
2. 批量提交任务 | |||
##### 批量提交任务 | |||
```bash | |||
choppy batch chenziyin/downsample-latest <SAMPLES_CSV> --project-name <PROJECT_NAME> |