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tasks/rmats.wdl
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| task rmats { | task rmats { | ||||
| String sample_id | String sample_id | ||||
| File b1_txt_file ## 阿里云不能直接读取txt内容 | File b1_txt_file ## 阿里云不能直接读取txt内容 | ||||
| Array[Array[File]] b1_txt = read_tsv(b1_txt_file) | |||||
| Array[Array[File]] b1_txt = read_csv(b1_txt_file) | |||||
| File b2_txt_file | File b2_txt_file | ||||
| Array[Array[File]] b2_txt = read_tsv(b2_txt_file) | |||||
| Array[Array[File]] b2_txt = read_csv(b2_txt_file) | |||||
| File reference_gtf_file | File reference_gtf_file | ||||
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