更新 'tasks/spladder.wdl'

tasks/spladder.wdl

@@ -19,6 +19,10 @@ task spladder {
         spladder build --bams ${bam} \
                 --annotation ${reference_gtf_file} \
                 --ignore-mismatches \
+                --confidence 2 \
+                --readlen 150 \
+                --sparse bam y \
+                --parallel 8 \
                 --outdir ${sample_id}/spladder_out
         
         find . -depth > fileList.txt