Przeglądaj źródła

更新 'tasks/spladder.wdl'

master
chenqingwang 3 lat temu
rodzic
commit
621156c80c
1 zmienionych plików z 4 dodań i 0 usunięć
  1. +4
    -0
      tasks/spladder.wdl

+ 4
- 0
tasks/spladder.wdl Wyświetl plik

spladder build --bams ${bam} \ spladder build --bams ${bam} \
--annotation ${reference_gtf_file} \ --annotation ${reference_gtf_file} \
--ignore-mismatches \ --ignore-mismatches \
--confidence 2 \
--readlen 150 \
--sparse bam y \
--parallel 8 \
--outdir ${sample_id}/spladder_out --outdir ${sample_id}/spladder_out
find . -depth > fileList.txt find . -depth > fileList.txt

Ładowanie…
Anuluj
Zapisz