Pārlūkot izejas kodu

更新 'tasks/spladder_single.wdl'

master
chenqingwang pirms 3 gadiem
vecāks
revīzija
2c3b9428c2
1 mainītis faili ar 5 papildinājumiem un 4 dzēšanām
  1. +5
    -4
      tasks/spladder_single.wdl

+ 5
- 4
tasks/spladder_single.wdl Parādīt failu

@@ -17,17 +17,18 @@ task spladder_single {
mkdir -p ${sample_id}/spladder_out

nt=$(nproc)
spladder build --bams ${bam} \
--annotation ${reference_gtf_file} \
--ignore-mismatches \
--verbose \
--confidence 2 \
--merge-strat single \
--sparse-bam \
--confidence 2 \
--readlen 150 \
--sparse-bam \
--parallel $nt \
--outdir ${sample_id}/spladder_out
--outdir ${sample_id}/spladder_out
find . -depth > fileList.txt
>>>

Notiek ielāde…
Atcelt
Saglabāt