2 fichiers modifiés avec 2 ajouts et 2 suppressions
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- 1
defaults
Voir le fichier
| @@ -1,6 +1,6 @@ | |||
| { | |||
| "starfusion_database_dir":"oss://pgx-reference-data/reference/starfusion/ctat_genome_lib_build_dir", | |||
| "starfusion_docker":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/trinityctat/starfusion:1.10.0", | |||
| "starfusion_docker":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/fusioncatcher:v1.33", | |||
| "starfusion_cluster":"OnDemand bcs.a2.large img-ubuntu-vpc", | |||
| "disk_size":"200" | |||
| } | |||
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- 1
workflow.wdl
Voir le fichier
| @@ -1,5 +1,5 @@ | |||
| import "./tasks/starfusion.wdl" as starfusion | |||
| workflow {{project_name}} { | |||
| workflow {{ project_name }} { | |||
| String sample_id | |||
| File fastq1 | |||
| File fastq2 | |||
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