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  1. import "./tasks/pindel.wdl" as pindel
  2. workflow {{ project_name }} {
  3. String sample_id
  4. File bam
  5. File reference
  6. File reference_fai
  7. String pindel_docker
  8. String pindel_cluster
  9. String disk_size
  10. call pindel.pindel as pindel {
  11. input:
  12. sample_id=sample_id,
  13. bam=bam,
  14. reference=reference,
  15. reference_fai=reference_fai,
  16. docker=pindel_docker,
  17. cluster=pindel_cluster,
  18. disk_size=disk_size
  19. }
  20. }