Bladeren bron

更新 'tasks/fusioncatcher.wdl'

add /
master
biochenglinliu 4 jaren geleden
bovenliggende
commit
ca76e5479f
1 gewijzigde bestanden met toevoegingen van 4 en 4 verwijderingen
  1. +4
    -4
      tasks/fusioncatcher.wdl

+ 4
- 4
tasks/fusioncatcher.wdl Bestand weergeven

@@ -12,10 +12,10 @@ task fusioncatcher{
set -o pipefail
set -e
mkdir -p ${sample_id}/input
mkdir -p ${sample_id}/output
cp ${fastq1} ${sample_id}/input
cp ${fastq2} ${sample_id}/input
mkdir -p ${sample_id}/input/
mkdir -p ${sample_id}/output/
cp ${fastq1} ${sample_id}/input/
cp ${fastq2} ${sample_id}/input/

/software/fusioncatcher/bin/fusioncatcher \
-d ${database_dir} \

Laden…
Annuleren
Opslaan