更新 'tasks/rediscoverte.wdl'

sf

tasks/rediscoverte.wdl

@@ -21,6 +21,7 @@ task rediscoverte {
         cp -r ${r_annotation} ./
         cp /software/REdiscoverTE/a.Rdata ./
         /opt/conda/bin/Rscript /software/REdiscoverTE/rollup.R
+        cp Step_2_salmon_counts/quant.sf ./${sample_id}_quant.sf
 
     >>>
 	
@@ -33,6 +34,7 @@ task rediscoverte {
 
     output {
         Array[File] te_result=glob("./Step_4_rollup2/*.RDS")
+        Array[File] te_quant=glob("./*.sf")
     }
 
 }