更新 'tasks/charger.wdl'

tasks/charger.wdl

@@ -22,9 +22,9 @@ task charger{
         
         mkdir ./input/
         mkdir ./output/
-        sed 's/chr//' ${vep_vcf} > ./input/${vep_index}.nochr.vcf 
+        sed 's/chr//' ${vep_vcf} > ./input/$vep_index.nochr.vcf 
 
-        charger -f ./input/${vep_index}.nochr.vcf \
+        charger -f ./input/$vep_index.nochr.vcf \
             -o ./output/$vep_index.charger.tsv \
             -D --inheritanceGeneList ${inheritanceGeneList} \
             -l --mac-clinvar-tsv ${clinvar} \