Update: VEP ncbi_build

tasks/VEP.wdl

@@ -75,7 +75,7 @@ task VEP {
     # --ccds --uniprot --hgvs --symbol --numbers --domains --gene_phenotype --canonical --protein --biotype --uniprot --tsl --variant_class --shift_hgvs 1 --check_existing --total_length --allele_number --no_escape --xref_refseq --failed 1 --flag_pick_allele --pick_order canonical,tsl,biotype,rank,ccds,length --force_overwrite --offline --pubmed --regulatory
     
     perl ${vep_path}/vep --format vcf --vcf \
-    --assembly ${ncbi_build} \
+    --assembly $ncbi_build \
     --species ${species} \
     --everything --af_exac \
     --offline \
@@ -90,7 +90,7 @@ task VEP {
     --input-vcf ${basename}.PASS.vep.vcf --output-maf ${basename}.PASS.maf \
     $vcf2maf_ID \
     --ref-fasta ${ref_dir}/${fasta} \
-    --ncbi-build ${ncbi_build} \
+    --ncbi-build $ncbi_build \
     --species ${species} \
     --vep-fork $nt
   >>>