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tasks/count.wdl
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| @@ -8,7 +8,7 @@ task count { | |||
| String disk_size | |||
| command <<< | |||
| python /count.py -s ${sample_id} -i ${readcount} -c ${bed} -o ${sample_id}.coverage | |||
| python /count_samtools.py -s ${sample_id} -i ${readcount} -c ${bed} -o ${sample_id}.coverage | |||
| >>> | |||
| runtime { | |||
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