Nevar pievienot vairāk kā 25 tēmas
Tēmai ir jāsākas ar burtu vai ciparu, tā var saturēt domu zīmes ('-') un var būt līdz 35 simboliem gara.
|
- task raw_depth {
- File raw_bam
- File raw_bam_idx
- String sample_id
- File regions
- String docker
- String cluster_config
- String disk_size
-
- command <<<
- /opt/conda/bin/samtools depth -aa -b ${regions} ${raw_bam} > ${sample_id}.raw.depth
- >>>
-
- runtime {
- docker:docker
- cluster: cluster_config
- systemDisk: "cloud_ssd 40"
- dataDisk: "cloud_ssd " + disk_size + " /cromwell_root/"
- }
- output {
- File bam_raw_depth = "${sample_id}.raw.depth"
- }
- }
|