YaqingLiu
/
cbcga-wes-qc
Obserwuj 1
Polub 0
Forkuj 0
Kod Zgłoszenia 0 Oczekujące zmiany 0 Wydania 0 Wiki Aktywność
Nie możesz wybrać więcej, niż 25 tematów Tematy muszą się zaczynać od litery lub cyfry, mogą zawierać myślniki ('-') i mogą mieć do 35 znaków.
3 Commity
1 Gałąź
Drzewo: af52eb35df
Gałęzie Tagi
${ item.name }
Utwórz gałąź ${ searchTerm }
z 'af52eb35df'
${ noResults }
cbcga-wes-qc/defaults

17 lines
1.0KB
Czysty Wina Historia 

  1. {

  2.   "fastqscreen_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/fastqscreen:0.12.0",

  3.   "fastqc_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/fastqc:0.11.8",

  4.   "qualimap_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/qualimap:2.0.0",

  5.   "sentieon_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/sentieon-genomics:v202010.02",

  6.   "CPU2_GB8_cluster": "OnDemand bcs.ps.g.large img-ubuntu-vpc",

  7.   "CPU4_GB16_cluster": "OnDemand bcs.ps.g.xlarge img-ubuntu-vpc",

  8.   "CPU8_GB32_cluster": "OnDemand bcs.ps.g.2xlarge img-ubuntu-vpc",

  9.   "disk_size": "300",

  10.   "SENTIEON_INSTALL_DIR": "/opt/sentieon-genomics",

  11.   "SENTIEON_LICENSE": "192.168.0.55:8990",

  12.   "covered_bed": "oss://pgx-reference-data/bed/cbcga/S07604514_Covered.bed",

  13.   "fastq_screen_conf": "oss://pgx-reference-data/fastq_screen_reference/fastq_screen.conf",

  14.   "screen_ref_dir": "oss://pgx-reference-data/fastq_screen_reference/",

  15.   "fasta": "GRCh38.d1.vd1.fa",

  16.   "ref_dir": "oss://pgx-reference-data/GRCh38.d1.vd1/"

  17. }