Calculate the bed coverage of multiple BAM files before and after dedup
Nie możesz wybrać więcej, niż 25 tematów Tematy muszą się zaczynać od litery lub cyfry, mogą zawierać myślniki ('-') i mogą mieć do 35 znaków.

16 lines
242B

  1. import "./tasks/bedtools.wdl" as bedtools
  2. workflow {{ project_name }} {
  3. File input_samples
  4. File bed_file
  5. Array[File] bam = read_lines(input_samples)
  6. call bedtools.bedtools as bedtools {
  7. input:
  8. bam=bam,
  9. bed_file=bed_file
  10. }
  11. }