YaqingLiu
/
bedtools-multicov
forkad från junshang/bedtools
Bevaka 1
Stjärnmärk 0
Förgrening 0
Kod Ärenden 0 Pull-förfrågningar 0 Släpp 0 Wiki Aktiviteter
Calculate the bed coverage of multiple BAM files before and after dedup
Du kan inte välja fler än 25 ämnen Ämnen måste starta med en bokstav eller siffra, kan innehålla bindestreck ('-') och vara max 35 tecken långa.
46 Incheckningar
1 Gren
Träd: 4436b7e55e
Grenar Taggar
${ item.name }
Skapa branchen ${ searchTerm }
från '4436b7e55e'
${ noResults }
bedtools-multicov/workflow.wdl

18 lines
322B
Rå Blame Historik 

  1. import "./tasks/bedtools.wdl" as bedtools

  2. 

  3. workflow {{ project_name }} {

  4. 

  5. 	File input_bam_file

  6. 	File input_bai_file

  7. 	File bed_file

  8. 	Array[File] bam = read_lines(input_bam_file)

  9. 	Array[File] bai = read_lines(input_bai_file)

  10. 	call bedtools.bedtools as bedtools {

  11. 			input:

  12. 			bam=bam,

  13. 			bai=bai,

  14. 			bed_file=bed_file

  15. 	}

  16. }