YaqingLiu
/
bedtools-multicov
sforkowany z junshang/bedtools
Obserwuj 1
Polub 0
Forkuj 0
Kod Zgłoszenia 0 Oczekujące zmiany 0 Wydania 0 Wiki Aktywność
Calculate the bed coverage of multiple BAM files before and after dedup
Nie możesz wybrać więcej, niż 25 tematów Tematy muszą się zaczynać od litery lub cyfry, mogą zawierać myślniki ('-') i mogą mieć do 35 znaków.
45 Commity
1 Gałąź
Drzewo: 30106ca512
Gałęzie Tagi
${ item.name }
Utwórz gałąź ${ searchTerm }
z '30106ca512'
${ noResults }
bedtools-multicov/workflow.wdl

18 lines
322B
Czysty Wina Historia 

  1. import "./tasks/bedtools.wdl" as bedtools

  2. 

  3. workflow {{ project_name }} {

  4. 

  5. 	File input_bam_file

  6. 	File input_bai_file

  7. 	File bed_file

  8. 	Array[File] bam = read_lines(input_bam_file)

  9. 	Array[File] bai = read_lines(input_bai_file)

  10. 	call bedtools.bedtools as bedtools {

  11. 			input:

  12. 			bam=bam,

  13. 			bai=bai,

  14. 			bed_file=bed_file

  15. 	}

  16. }