Calculate the bed coverage of multiple BAM files before and after dedup
選択できるのは25トピックまでです。 トピックは、先頭が英数字で、英数字とダッシュ('-')を使用した35文字以内のものにしてください。

526B

Author: Jun Shang

Email: shangjunv@163.com

Last Updates: 20/03/2020

Requirements

  • choppy
  • Ali-Cloud
$ source activate choppy
$ choppy install junshang/bedtools
$ choppy apps

quick start

  • 将 input_samples.tsv 放到阿里云,路径用户自己设定

input_samples_file.tsv 格式参考上述示例文件

  • 准备 samples.csv 文件,如下:
$ choppy samples junshang/bedtools-latest > samples.csv
$ choppy batch junshang/bedtools-latest samples.csv -p Your_project_name