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revised-bedtools-task

master
stead99 5 anos atrás
pai
commit
bed278719f
1 arquivos alterados com 0 adições e 3 exclusões
  1. +0
    -3
      tasks/bedtools.wdl

+ 0
- 3
tasks/bedtools.wdl Ver arquivo

@@ -10,9 +10,6 @@ task bedtools {

command <<<
set -e -o pipefail
mkdir -p /cromwell_root/tmp/bedtools
mv ${sep=' ' bai} /cromwell_root/tmp/bedtools
cd /cromwell_root/tmp/bedtools
bedtools multicov -bams ${sep=' ' bam} -bed ${bed_file} > revread_count.txt

>>>

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