Calculate the bed coverage of multiple BAM files before and after dedup
Вы не можете выбрать более 25 тем Темы должны начинаться с буквы или цифры, могут содержать дефисы(-) и должны содержать не более 35 символов.

5 лет назад
1234567891011121314151617181920212223242526272829
  1. > Author: Jun Shang
  2. >
  3. > Email: shangjunv@163.com
  4. >
  5. > Last Updates: 20/03/2020
  6. #### Requirements
  7. - choppy
  8. - Ali-Cloud
  9. ```
  10. $ source activate choppy
  11. $ choppy install junshang/bedtools
  12. $ choppy apps
  13. ```
  14. #### quick start
  15. 1. 将 input_samples.tsv 放到阿里云,路径用户自己设定
  16. > input_samples_file.tsv 格式参考上述示例文件
  17. 2. 准备 samples.csv 文件,如下:
  18. ```
  19. $ choppy samples junshang/bedtools-latest > samples.csv
  20. $ choppy batch junshang/bedtools-latest samples.csv -p Your_project_name
  21. ```