bedtools-multicov/README.md

> Author: Jun Shang
>
> Email: shangjunv@163.com
>
> Last Updates: 20/03/2020

#### Requirements

- choppy
- Ali-Cloud

```
$ source activate choppy
$ choppy install junshang/bedtools
$ choppy apps
```

#### quick start

- 将 input_bam.tsv 和 input_bai.tsv 放到阿里云，路径用户自己设定

  > input_bam.tsv 和 input_bai.tsv 格式参考上述示例文件

- 准备 samples.csv 文件，如下：

```
$ choppy samples junshang/bedtools-latest > samples.csv
$ choppy batch junshang/bedtools-latest samples.csv -p Your_project_name
```