bcftools-merge is used to merge VCF files into a singe VCF.
Du kan inte välja fler än 25 ämnen Ämnen måste starta med en bokstav eller siffra, kan innehålla bindestreck ('-') och vara max 35 tecken långa.

README.md 397B

5 år sedan
4 år sedan
5 år sedan
4 år sedan
1234567891011121314151617
  1. #### Usage
  2. $ open-choppy-env
  3. $ choppy install YaqingLiu/bcftools
  4. #### Input File
  5. Input file should be in the form of json.
  6. For example:
  7. ```
  8. {
  9. "vcf": [
  10. "oss://choppy-cromwell-result/test-choppy/..._pon.vcf",
  11. "oss://choppy-cromwell-result/test-choppy/..._pon.vcf",
  12. "oss://choppy-cromwell-result/test-choppy/..._pon.vcf"
  13. ],
  14. "sample_id": "somatic_normal"
  15. }
  16. ```