bamdst is a lightweight tool to stat the depth coverage of target regions of bam file(s).
Du kan inte välja fler än 25 ämnen Ämnen måste starta med en bokstav eller siffra, kan innehålla bindestreck ('-') och vara max 35 tecken långa.

workflow.wdl 418B

5 år sedan
5 år sedan
5 år sedan
1234567891011121314151617181920212223
  1. import "./tasks/bamdst.wdl" as bamdst
  2. workflow {{ project_name }} {
  3. File bam
  4. File bai
  5. File bed
  6. String sample
  7. String docker
  8. String cluster_config
  9. String disk_size
  10. call bamdst.bamdst as bamdst {
  11. input:
  12. bam=bam,
  13. bai=bai,
  14. bed=bed,
  15. sample=sample,
  16. docker=docker,
  17. disk_size=disk_size,
  18. cluster_config=cluster_config
  19. }
  20. }