Você não pode selecionar mais de 25 tópicos
Os tópicos devem começar com uma letra ou um número, podem incluir traços ('-') e podem ter até 35 caracteres.
873B
873B
README.md
Author: Qingwang Chen
Email: qwch20@fudan.edu.cn
Last Updates: 16/10/2020
Requirements
- choppy
- Ali-Cloud
# 激活choppy环境
$ source activate choppy (open-choppy-env)
# 第一次安装
$ choppy install chenqingwang/bam-readcount
# 非第一次安装
$ choppy install chenqingwang/bam-readcount -f
# 查询已安装APP
$ choppy apps
Quick Start
```
准备 samples.csv 文件
$ choppy samples junshang/bedtools-latest > samples.csv
提交任务
$ choppy batch junshang/bedtools-latest samples.csv -p Your_project_name -l Your_label
查询任务运行状况
$ choppy query -L Your_label | grep “status”
查询失败任务
$ choppy search -s Failed -p Test_bamreadcount_chenqingwang_20201016 -u chenqingwang --short-format
结果文件地址
$ oss://choppy-cromwell-result/test-choppy/Your_project_name/