2個のファイルの変更、5行の追加、2行の削除
+ 3
- 0
.gitignore
ファイルの表示
| # jun shang samples test ignore | |||||
| choppy_samples.csv | |||||
| input_samples_test.txt |
+ 2
- 2
tasks/fastqscreen.wdl
ファイルの表示
| File read2 | File read2 | ||||
| File screen_ref_dir | File screen_ref_dir | ||||
| File fastq_screen_conf | File fastq_screen_conf | ||||
| String read1name=sub(basename(read1),"\\.\\S+$", "") | |||||
| String read2name=sub(basename(read2),"\\.\\S+$", "") | |||||
| String read1name=sub(basename(read1),"\\.(fastq|fq)\\.gz$", "") | |||||
| String read2name=sub(basename(read2),"\\.(fastq|fq)\\.gz$", "") | |||||
| String docker | String docker | ||||
| String cluster_config | String cluster_config | ||||
| String disk_size | String disk_size |
読み込み中…