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- task merge_info {
- File vcfInfo
- File mendelianInfo
- String sample
- String docker
- String cluster_config
- String disk_size
-
- command <<<
-
- python /opt/merge_mendelian_vcfinfo.py -vcfInfo ${vcfInfo} -mendelianInfo ${mendelianInfo} -sample ${sample}
-
- >>>
-
- runtime {
- docker:docker
- cluster: cluster_config
- systemDisk: "cloud_ssd 40"
- dataDisk: "cloud_ssd " + disk_size + " /cromwell_root/"
- }
- output {
- File all_info = "${sample}_mendelian_vcfInfo.vcf"
- }
- }
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