Ви не можете вибрати більше 25 тем Теми мають розпочинатися з літери або цифри, можуть містити дефіси (-) і не повинні перевищувати 35 символів.

28 lines
601B

  1. task mergeBed {
  2. Array[File] chromo_filtered_bed
  3. Array[File] chromo_voted_bed
  4. String sample_name
  5. String docker
  6. String cluster_config
  7. String disk_size
  8. command <<<
  9. cat ${sep=" " chromo_filtered_bed} | sort -k1,1 -k2,2n > ${sample_name}.filterd.bed
  10. cat ${sep=" " chromo_voted_bed} | sort -k1,1 -k2,2n > ${sample_name}.voted.bed
  11. >>>
  12. runtime {
  13. docker:docker
  14. cluster: cluster_config
  15. systemDisk: "cloud_ssd 40"
  16. dataDisk: "cloud_ssd " + disk_size + " /cromwell_root/"
  17. }
  18. output {
  19. File filtered_bed = "${sample_name}.filterd.bed"
  20. File voted_bed = "${sample_name}.voted.bed"
  21. }
  22. }