No puede seleccionar más de 25 temas
Los temas deben comenzar con una letra o número, pueden incluir guiones ('-') y pueden tener hasta 35 caracteres de largo.
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- task rtg {
- File vcf
- String sample = basename(vcf,".vcf")
- String docker
- String cluster_config
- String disk_size
-
- command <<<
- rtg bgzip ${vcf} -c > ${sample}.vcf.gz
- rtg index -f vcf ${sample}.vcf.gz
- >>>
-
- runtime {
- docker:docker
- cluster: cluster_config
- systemDisk: "cloud_ssd 40"
- dataDisk: "cloud_ssd " + disk_size + " /cromwell_root/"
- }
- output {
- File vcf_gz = "${sample}.vcf.gz"
- File vcf_index = "${sample}.vcf.gz.tbi"
- }
- }
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