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542B
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中华家系1号标准物质室间质评报告系统分析流程
1. 中华家系1号标准物质介绍
2. 分析流程图
3. 各模块运行流程
准备inputSamplesFIle (tsv格式)
#fastq_read1 #fastq_read2 #bam #bai #vcf #sample_mark
(1) fastqc
(2) fastqscreen
(3) qualimap
(4) benchmarking (hap.py)
(5) multiqc
(6) VcfStats
注：可查询multiqc支持的指控模块，按需求添加 https://multiqc.info/docs/#multiqc-modules