室间质评
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  1. task vcfstat {
  2. File vcf
  3. String docker
  4. String cluster_config
  5. String disk_size
  6. command <<<
  7. set -o pipefail
  8. set -e
  9. rtg vcfstats ${vcf} > onestats.txt
  10. >>>
  11. runtime {
  12. docker:docker
  13. cluster:cluster_config
  14. systemDisk:"cloud_ssd 40"
  15. dataDisk:"cloud_ssd " + disk_size + " /cromwell_root/"
  16. }
  17. output {
  18. File vcfnumber="onestats.txt"
  19. }
  20. }