LUYAO REN
6 лет назад
1 измененных файлов: 1 добавлений и 1 удалений
+ 1
- 1
tasks/novoalign.wdl
Просмотреть файл
| set -o pipefail | set -o pipefail | ||||
| set -e | set -e | ||||
| nt=$(nproc) | nt=$(nproc) | ||||
| novoalign -d ${NVref_dir}/${index} -f ${fastq_1} ${fastq_2} -o SAM -c $nt > ${sample}.novoalign.sam | |||||
| /opt/novoalign -d ${NVref_dir}/${index} -f ${fastq_1} ${fastq_2} -o SAM -c $nt > ${sample}.novoalign.sam | |||||
| >>> | >>> | ||||
| runtime { | runtime { |
Загрузка…