LUYAO REN
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tasks/CallableLoci.wdl
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| @@ -13,7 +13,7 @@ task CallableLoci { | |||
| command <<< | |||
| set -o pipefail | |||
| set -e | |||
| java -jar GenomeAnalysisTK.jar \ | |||
| java -jar /usr/GenomeAnalysisTK.jar \ | |||
| -T CallableLoci \ | |||
| -R ${ref_dir}/${fasta} \ | |||
| -I ${bam} \ | |||
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