共有 1 个文件被更改，包括 1 次插入 和 1 次删除
+ 1
- 1
tasks/TNseq.wdl
查看文件
| --algo TNhaplotyper2 $SAMPLE \ | --algo TNhaplotyper2 $SAMPLE \ | ||||
| --germline_vcf ${germline_resource} \ | --germline_vcf ${germline_resource} \ | ||||
| ${sample_id}.TNseq.raw.vcf \ | ${sample_id}.TNseq.raw.vcf \ | ||||
| --algo OrientationBias --tumor_sample ${tumor_name} \ | |||||
| --algo OrientationBias \ | |||||
| ${sample_id}.orientation \ | ${sample_id}.orientation \ | ||||
| --algo ContaminationModel $SAMPLE \ | --algo ContaminationModel $SAMPLE \ | ||||
| --vcf ${germline_resource} \ | --vcf ${germline_resource} \ |
正在加载...