meng
/
strelka_pipeline
Sledovat 1
Oblíbit 0
Rozštěpit 0
Zdrojový kód Úkoly 0 Požadavky na natažení 0 Vydání 0 Wiki Aktivita
Nelze vybrat více než 25 témat Téma musí začínat písmenem nebo číslem, může obsahovat pomlčky („-“) a může být dlouhé až 35 znaků.
37 Revize
1 Větev
Větev: master
Větve Značky
${ item.name }
Vytvořit větev ${ searchTerm }
z „master“
${ noResults }
strelka_pipeline/defaults

14 lines
654B
Surový Trvalý odkaz Blame Historie 

  1. {

  2.         "ref_fasta":"GRCh38.d1.vd1.fa",

  3.         "ref_dir":"oss://hcc1395/reference_genome/GRCh38.d1.vd1/",

  4.         "ref_bed":"GRCh38.bed.gz",

  5.         "sample_id":"",

  6.         "docker_stralka":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/strelka:v2.9.10",

  7.         "cluster_config":"OnDemand bcs.es.c.8xlarge img-ubuntu-vpc",

  8.         "disk_size":"500",

  9. 		"manta_indel_vcf":"",

  10.         "manta_indel_vcf_index":"",

  11. 		"docker_bcftools":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/delly:1.1.6",

  12. 		"docker_annovar":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/annovar:v20191024",

  13. 		"annovar_database":"oss://hcc1395/reference_genome/annovar/"

  14. }