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workflow.wdl
Voir le fichier
| @@ -9,6 +9,7 @@ workflow {{ project_name }} { | |||
| File normal_bam_bai | |||
| String ref_fasta | |||
| File ref_dir | |||
| File ref_bed | |||
| String sample_id | |||
| File? manta_indel_vcf | |||
| File? manta_indel_vcf_index | |||
| @@ -29,6 +30,7 @@ workflow {{ project_name }} { | |||
| normal_bam_bai=normal_bam_bai, | |||
| ref_fasta=ref_fasta, | |||
| ref_dir=ref_dir, | |||
| ref_bed=ref_bed, | |||
| sample_id=sample_id, | |||
| docker=docker_stralka, | |||
| cluster_config=cluster_config, | |||
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